作者:周井祥; 王好; 吕文亮; 李新伟锦鲤疱疹病毒orf124基因生物信息学分析
摘要:为研究我国锦鲤疱疹病毒的基因背景信息,从锦鲤疱疹病毒中国吉林株(KHV—cJ株)获得ORF124基因,应用生物信息学方法分析KHV—CJ株ORF124基因结构和功能,并与Genbank上已公布的三株KHV进行比较分析。结果显示,ORF124基因的理论分子质量为31221.96Da,KHV—CJ株与其他三株KHV同源性均为99%;信号肽切割部位最可能位于24位的T(苏氨酸)和25位的V(缬氨酸)氨基酸之间;ORF124基因无跨膜区;氨基酸序列不存在潜在的N-糖基化位点、11个潜在的O-糖基化位点和7个磷酸化位点。该蛋白的表面抗原决定簇位点区域广泛、峰值高,预示该基因可作为基因工程疫苗的重要候选基因。
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