作者：苗作云; 杨赟; 刘攀峰; 郑新芳; 杜红岩; ...杜仲红叶微卫星转录组高通量测序
摘要：对‘华仲12号’杜仲的幼嫩叶片（绿色）和成熟叶片（红色）及‘华仲11号’杜仲成熟叶片（绿色）进行转录组测序，进行测序数据的拼接和组装，且对转录组获得的基因（Unigenes）进行SSR分析。研究得到54517条平均长度为806．90bp的Unigenes，其中25993条Unigenes在Nr、Swiss—Prot、KEGG和COG蛋白数据库获得功能注释，占所有Unigenes的47．68％。参照KEGG数据库，可将注释到的6910条Unigenes划分到122个代谢途径分支，其中花色苷代谢途径相关酶基因39个，类黄酮代谢途径38个，类胡萝卜素合成途径34个。54517条Uni．genes中共包含17010个完整型SSR位点，占总SSR位点的96．28％。完整型SSR位点共包含67种重复基元。其中出现频率最高的重复基元类型为单核苷酸重复中的A／T（7747个），其次是AG／CT（5039个）和AT／AT（850个）从花色苷代谢途径、类黄酮代谢途径及类胡萝b素代谢途径中共找到13个SSR位点。为今后杜仲遗传多样性分析、遗传图谱构建及杜仲红叶性状分子标记开发等方面奠定了分子基础。
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