作者：田尊哲; 高庆波; 陈世龙; 张发起蓝玉簪龙胆高通量测序微卫星单核苷酸多态性青藏高原
摘要：利用Illumina HiSeqTM2500平台对青海省库泽县的蓝玉簪龙胆（Gentiana veitchiorum）进行高通量测序，共得到SSR序列8588条，对其SSR重复类型进行分析；三核苷酸重复类型所占的比例最大占54．7％（4696）；其次是二核苷酸重复类型占41．3％（3543）；四核苷酸重复类型，五核苷酸重复类型和六核苷酸重复类型所占的比例较少（共占4％）。在二核苷酸重复类型中AT／TA重复类型所占的比例最大分别为9．85％和9．5％。在微卫星中重复单元的长度大小和重复次数成负相关，并且微卫星的总长度与重复单元的长度成正相关。在蓝玉簪龙胆的花（GP—F）和叶（GP—L）中分别得到253789和249417个SNP位点，其中在非编码区上的比例为51．29％和51．96％。分析发现蓝玉簪龙胆SNP位点在编码区中同义转换所占的比例（48．63％和47．96％）要远远高于非同义转换的比例（0．08％和0．08％），可能与功能基因序列相对稳定有关。
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