作者:李晓华; 丁明亮; 乔玲; 李刘军; 杨堤贻; ...粗山羊草cct基因家族正选择效应生物钟效应
摘要:CCT家族基因广泛参与植物花期的调控过程,粗山羊草(AegilopstauschiiCoss.)作为小麦D基因组供体,给小麦带来新的花期及适应性相关基因。研究粗山羊草CCT家族基因不仅可为小麦进化、驯化和演变规律提供参考,还有助于认识粗山羊草作为杂草的生态适应性。粗山羊草基因组中26个CCT基因进化分析后发现GroupA、GroupC、GroupH和GroupG中的13个AetCCT成员出现了快速进化:GroupA中有42.1%的位点存在正选择效应,表明快速进化提高了粗山羊草的适应性。基因结构分析表明CCT结构域在AetCCT家族中保守性很高,但不同基因内含子和外显子的排布差异较大.特异Motif可能是不同亚家族基因间功能差异的重要原因。AetCCT4、AetCCT7、AetCCT8、AetCCT11、AetCCT12、AetCCT16、AetCCT17、AetCCT19、AetCC72J和AetCC22的表达具有明显的“生物钟效应”,呈现出24h的节律性表达,且基本都处于快速进化的GroupA、GroupC、GroupH和GroupI。研究结果表明,这些成员可能参与花期调控等生长发育过程,在粗山羊草的适应性形成过程中发挥了作用。
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