作者:张泽杰; 付喜玲; 肖伟; 李玲; 高东升; 李...ppcambp生物信息学分析表达分析
摘要:果实缝合线塌陷是‘肥城’桃(Prunus persica cv. Feicheng)生产上常见的病害,常被认为与钙信号调控有关。钙调素结合蛋白作为钙信号调控系统的重要组成部分,是研究钙信号作用机制的关键因子。本试验利用PF07839探针在‘肥城’桃果实中发现4个PpCaMBP基因,并对其进行亚细胞定位预测、结构域、进化树等生物信息学分析;对Ca2+(硝酸钙)、三氟拉嗪(TFP)、Ca2++TFP、清水(对照)处理的果实进行PpCaMBP基因表达分析,筛选与‘肥城’桃缝合线塌陷相关的PpCaMBP候选基因。生物信息学分析发现:4个基因均为定位于细胞核的钙调素结合蛋白基因,其中Prupe.7G047600与樱桃的pav sc0001869.1.g380.1.mk具有较近的亲缘关系。定量分析结果表明:与正常果相比,病果中Prupe.7G047600在缝合线处表达量下降;与不易发病的白里桃相比,Prupe. 7G047600在红里桃各部位的表达量普遍较低;Ca2+处理促进Prupe.7G047600基因的表达;Prupe.7G047600可能是参与‘肥城’桃缝合线塌陷症状调控的候选基因。
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