作者：丁爱琴; 李绍翠; 刘庆超; 王奎玲; 李伟; ...切花月季rhataf1实时定量pcr表达特性
摘要：以切花月季‘萨蔓莎’为材料,从花瓣水分胁迫抑制消减杂交文库中获得NAC转录因子基因片段,利用RACE技术分离获得一个新的NAC类型的转录因子,命名为RhATAF1。RhATAF1开放阅读框包含890bp(登录号为MG878302),编码289个aa,由3个外显子和2个内含子组成。生物信息学分析结果显示,RhATAF1蛋白分子量为32.9kDa,等电点pI为7.58。RhATAF1二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主,β-折叠较少。蛋白序列多重比较发现,RhATAF1具有高度保守的N端DNA结构域及高度分化的C端转录调节区域,N端区域包含了A、B、C、D、E 5个不同的亚结构域。系统发育分析表明RhATAF1与拟南芥ATAF1同源性最高,属于SNAC类转录因子。利用实时定量PCR技术分析了RhATAF1的表达模式,结果显示,水分胁迫12h处理显著提高了RhA-TAF1的表达水平,脱落酸和赤霉素处理诱导了RhATAF1的转录本表达上调。
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