作者：张璇; 赵慧琪; 王德富; 郭尚; 刘勇; 牛颜...番茄黄瓜花叶病毒序列分析亚组分类分析
摘要：在生物学检测的基础上,利用酶联免疫检测、非序列依赖性PCR（sequence-independent amp-lification,SIA）对感病番茄进行分子鉴定,表现卷叶和花叶症状的番茄均被黄瓜花叶病毒（Cucumber mosaic virus,CMV）侵染,分离物分别命名为SXFQ（GenBank登录号为JX993914）和FQ（GenBank登录号为JX993912）。为明确其分类地位,对二者外壳蛋白（coat protein,CP）进行克隆和测序分析。应用DNAMAN软件对本课题组前期检测的7个CMV山西分离物、SXFQ、FQ以及其他3个CMV典型分离物CP序列进行比较分析,发现核苷酸和氨基酸序列最大相似性分别为77.1%-100%和81.6%-100%。氨基酸序列系统进化分析表明,9个CMV山西分离物属于CMV亚组I B的2个分支,其中在指示植物上表现较强症状的SXFQ与其他5个分离物为一分支,在指示植物上表现较弱症状的FQ与其他2个分离物为另一分支。对9个山西分离物CP进行亚组分类分析,结果表明其理化性质、稳定性、疏水性与预测结果相近,2个分支的分离物分别出现相近的氨基酸变异和蛋白结构,存在一定规律性。
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