作者:庄晓峰; 董海涛; 李德葆水稻稻瘟病菌cdna微阵列基因表达谱检测
摘要:利用含1106条水稻独立基因的cDNA微阵列,检测水稻近等基因系H7R/H7S受稻瘟病菌诱导8 h的表达谱差异.结果显示:基因表达谱变化明显,在980组有效数据中,共检测到170条基因的表达丰度发生显著变化,其中上调表达基因106条,下调表达基因64条.通过与NCBI水稻数据库进行BLASTn比对分析,发现这些差异表达基因包含β-1,3-葡聚糖酶、富甘氨酸蛋白在内的已知基因33条,未知基因137条.对10个未知基因进行生物信息学分析后,其中获得一个含全长基因并具有BTB/POZ结构域的克隆T007F02(www.estarray.org),该基因命名为OsBTB.该克隆的cDNA序列具有完整的ORF区,OsBTB上游具有典型的启动子区.结果经测序得到证实.高通量的RNA斑点杂交证实:在抗性供试水稻中,该基因在水稻接种稻瘟病菌早期(8~12 h)受诱导高表达;在感病品种中,该基因表达无明显改变.结果提示OsBTB基因在功能上可能与水稻抗瘟性过程密切相关.
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