作者：甘海锋; 陈雯; 陈夕军; 张坤; 贺振水仙黄条病毒水仙退化病毒种群结构遗传多样性
摘要：为防控水仙黄条病毒(narcissus yellow stripe virus,NYSV)和水仙退化病毒(narcissus degen‐eration virus,NDV),于2017年4月在江苏省2个市采集24个水仙病样,通过逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription-PCR,RT-PCR)检测,从6个水仙样品中获得与预期大小一致的核苷酸片段,通过克隆CP基因和序列分析,结合GenBank中已报道的相关序列对所获得的4条NYSV序列和2条NDV序列进行种群结构及遗传多样性分析。结果显示,仅在NYSV CP基因中发现4个重组位点;NYSV CP多样性程度很高,相似值高于75%,而NDV CP相似值高达96%;在系统发育树中,NYSV分离物被分为4组,NDV分离物被分为2组;日本NYSV分离物核苷酸多样性较高,为0.136,而NDV中国种群核苷酸多样性较高,为0.012;NYSV CP基因中II组与III组的遗传距离最高,为0.332,NDV中国分离物与日本分离物间的遗传距离差异明显,为0.104;NYSV中国种群与日本种群的遗传差异为0.166,存在一定的基因交流;NYSV与NDV的CP基因均处于负选择压力作用下。
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