作者：邓丽丽; 李德龙; 蔡年辉; 周军; 孙琪; 唐...思茅松高通量测序微卫星
摘要：以思茅松针叶为材料,采用Illumina Hiseq2000平台测序,得到121 882条无冗余的序列,对这些序列进行SSR位点搜索,共获得3534个SSR位点,出现频率为2.9%,分布平均距离25kb。所搜索的SSR以单核苷酸重复类型最多,其次为三核苷酸和二核苷酸,而四、五、六核苷酸重复类型较少（〈1%）。单核苷酸重复类型中以A/T基元较丰富（43.58%）;二核苷酸中出现频率最高的是AT/TA基元（14.04%）,AG/CT次之,AC/GT和CG/CG较低;三核苷酸重复类型中AAG/CTT最多,AGC/CTG和AGG/CCT次之,以CCG/CGG、ACG/CGT和ACT/AGT较少（〈1%）;四、五、六核苷酸类型中各重复基元相差不大,均较少。SSR数量随对应的重复类型重复次数的增加而降低,也随重复区段碱基长度的增加而降低。
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