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siRNA对SGC7901/VCR细胞mdr1基因沉默效果的影响因素分析

作者:高福莲; 朱晓燕; 王峰; 吴景兰; 张钦宪小分子干扰rnamdr1基因基因沉默效果sirna设计

摘要:目的 分析siRNA沉默人胃癌SGC7901/VCR细胞mdr1基因效果的相关因素。方法 设计并体外转录合成4条靶向mdr1的siRNA(mdrlsi326、mdrlsi1513、mdrlsi2631和mdrlsi3071),转染SGC7901/VCR细胞,用RT-PCR和免疫印迹检测mdr1mRNA和P-gp的表达、流式细胞仪检测细胞内阿霉素的蓄积和舯法检测细胞对阿霉素的敏感性,综合这4方面结果评价4条siRNA的沉默效果情况;用分子生物学软分析siRNA沉默效果的影响因素。结果 沉默效果最好的mdr1si326和较好的mdrlsi2631靶序列编码P-gp的跨膜区而且自身无茎和袢;沉默效果较差的mdrlsi3071和最差的mdrlsi1513靶序列编码P-gp的胞内区,前者自身成茎和成袢。沉默效果最好的mdrlsi326和较好的mdrlsi2631靶序列在靶位点和靶住点外间有较少的碱基配对和氢键。siRNA的沉默效果与siRNA3’5’端3个碱基中的A/U数量、N1和N19、GC含量间无规律可循。结论 siRNA沉默SGC7901/VCR细胞mdr1的效果与靶序列的结构关系密切。

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肿瘤防治研究

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