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加权基因共表达网络分析技术在人类肿瘤研究中的应用

作者:王耀群; 陈博; 黄甫春; 周卫国; 张丰肿瘤计算生物学高通量筛选分析加权基因共表达网络分析

摘要:加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)技术是一种在高通量基因表达数据中,利用系统生物学思想,寻找基因表达相关性,并构建基因模块,进而发现具有生物学意义模块的高通量数据挖掘算法。近年来,随着人类对疾病的认识深入到基因水平,WGCNA越来越多的应用于各种疾病,尤其在肿瘤相关基因的高通量数据的挖掘之中。并且,随着技术的不断完善,该技术在疾病的发病机制、发展过程和治疗方案等的探索中,由单一的共表达网络分析逐渐发展成为与多种技术诸如基于连锁不平衡的全基因组关联分析、支持向量机联合应用以及创新性应用WGCNA进行高通量数据挖掘。作为基于基因层次的高通量研究方法,WGCNA正发挥着重要作用。

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肿瘤

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