作者：刘加林; 刘士力; 蒋文枰; 程顺; 迟美丽; ...河川沙塘鳢生长激素克隆序列分析生物信息学
摘要：利用长片段PCR、基因组步移法及T-A克隆技术,成功克隆出河川沙塘鳢( Odontobutis potamophila ) GH 基因全长序列,提交至GenBank获得登录号MH717101。河川沙塘鳢 GH 基因全序列长5120 bp,5′端和3′端侧翼序列长度分别为920、682 bp,经预测,上游区域含有MF3、GAGA factor、HNF-3alpha、C/EBP、R2、GATA-1等多种转录调控元件;转录单元长3 518 bp,包含4个内含子和5个外显子,4个内含子大小分别为75、333、2 070和121 bp,5个外显子长度分别为150、131、117、138和373 bp,第3内含子长达2 070 bp,其长度是翘嘴鲌( Culter alburnus )第3内含子的4倍以上;开放阅读框区(open reading frame,ORF)为594 bp,编码由197个氨基酸残基组成的蛋白质多肽。河川沙塘鳢与鲈形目、鲉形目、鲤形目、鲇形目等13种鱼类的氨基酸序列同源性比较表明,其与彼氏冰鰕虎鱼( Leucopsarion petersii )同源性最高,为83.8%,与草鱼( Ctenopharyngodon idella )同源性最低,为49.1%,在180~197氨基酸序列处,河川沙塘鳢表现出高度不保守性,与所列鱼类氨基酸排列均完全不一致。该研究结果为进一步研究河川沙塘鳢 GH 基因的表达、功能及其转录调控特征奠定了分子基础。
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