作者：吴伟; 冯志娟; 徐盛春; 刘娜; 张古文; 胡...大豆nip水孔蛋白全基因组鉴定组织表达干旱应答
摘要：NIPs（nodulin 26-like intrinsic proteins）是类根瘤菌26膜内在蛋白，属于水孔蛋白的一个亚类，在植物逆境胁迫应答过程中发挥重要作用。利用大豆基因组数据库，在全基因组水平共鉴定得到13个 GmNIPs 。染色体定位分析显示，这些 GmNIPs 基因分布在大豆11条染色体上。理化性质分析显示，GmNIPs蛋白氨基酸数目为261～296，蛋白分子量为27～32 ku，蛋白等电点为6～10。蛋白多序列比对分析发现，所有GmNIPs均含有水通道蛋白的典型结构，6个保守的跨膜螺旋（TM1-TM6）和2个保守的氨基酸元件NPA盒（Asp-Pro-Ala box）。进化树分析发现，大豆GmNIPs与拟南芥和水稻NIPs分类完全一致。基因结构分析显示，所有 GmNIPs 基因均由5个外显子和4个内含子组成。启动子分析表明，多数 GmNIPs 基因的上游启动子区含有逆境和激素应答元件。组织表达分析发现，5个 GmNIPs 的基因表达量相对较高。进一步，利用荧光定量PCR对 GmNIP 1;5的干旱胁迫表达特性进行了分析。
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