作者：李文丽; 杜晓华; 刘霞; 高景波; 申超超; ...藏绵羊fam134b基因cds区克隆生物信息学分析表达
摘要：采用RT-PCR技术克隆了藏绵羊FAM134B（family with sequence similarity 134,member B）基因,利用生物学软件进行相关生物信息学分析,同时用实时荧光定量PCR（real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR）研究组织表达水平。克隆获得FAM134B基因全长1 144 bp（Gen Bank登录号：KX580309）,开放阅读框1 071 bp,编码356个氨基酸。系统进化树表明,藏绵羊FAM134B和绵羊、山羊关系较近。藏绵羊FAM134B基因编码蛋白的分子式为C_（1717）H_（2696）N_（448）O_（572）S_（12）,分子量为39 151.72 u,理论等电点（pI）为4.49,消光系数为24 450,不稳定系数为43,疏水指数为80.31,平均亲水性为-0.422,属不稳定可溶性酸性蛋白质。二级结构主要是α-螺旋（45.51%）、无规卷曲（41.85%）和延伸链（12.64%）,属于混合类蛋白质。亚细胞定位和功能分析结果显示,FAM134B编码的蛋白在内质网、细胞质膜概率分别为30.4%和21.7%,主要在蛋白质运输和结合（77.3%）方面起作用。系统发育树表明,藏绵羊FAM134B氨基酸序列与绵羊、山羊同源性非常高。qRT-PCR结果表明,FAM134B基因网胃中表达最高,十二指肠表达量最低。研究结果可为进一步研究藏绵羊FAM134B基因结构和生理功能及其遗传特性提供理论依据。
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