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基于克隆文库筛选的池设计

作者:管宇克隆文库池设计群试分离矩阵信息界

摘要:池设计(pooling design)是基于克隆文库筛选(clone library screening)的一种实验设计,要求从大量的克隆体中筛选出其中舍有某组特定核苷酸串的克隆体,它属于组合群试。一个池设计方案用一个二元关联矩阵(称为分离矩阵)表示,行对应于试验,列对应于克隆集合的体;考虑到生物实验存在误差,分离矩阵还需要有查错和纠错能力。利用子集或子空间之间的包含关系可以构建出分离矩阵,它的每行和每列中元素1的个数分别都一样,但试验总次数即行数明显大于信息下界。

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浙江农林大学学报

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