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常染色体显性多囊肾组织差异表达基因的初步研究

作者:张维莉; 吴玉梅; 葛守一; 梅长林多囊肾病常染色体显性差异表达基因

摘要:目的应用基因芯片技术及最新公共数据库,筛选常染色体显性多囊肾组织中差异表达的基因,对其进行功能分类,并对其中1条基因利用原位杂交技术进行验证.方法将代表8398条人类基因的PCR产物制成基因芯片.将等量的多囊肾组织和正常肾组织mRNA分别用Cy5、Cy3荧光标记,逆转录合成cDNA探针,混合后与上述基因芯片杂交.扫描杂交信号荧光强度,找出差异表达基因,对获得的基因进行分子生物信息学分析.并对其中的上调表达基因IGF1 mRNA进行原位杂交,验证基因芯片结果的准确性.结果 (1)在进入研究的8398条基因中,共发现357条差异表达基因.94条基因在多囊肾组织中低表达,263条基因高表达;(2)上调表达基因主要属于原癌基因,细胞骨架蛋白和运动相关蛋白,凋亡相关蛋白,细胞信号和传递蛋白,细胞因子;下调表达基因主要属于抑癌基因,DNA结合、转录和转录因子,细胞信号和传递蛋白,参与代谢的基因;(3)IGF1 mRNA原位杂交结果与芯片结果一致.结论基因表达谱芯片可快速、高效地筛选差异表达基因;多囊肾病的发生、发展中存在着多种不同功能基因表达调控的改变.

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中华医学遗传学

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