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嗜水气单胞菌TaqMan实时PCR检测方法的建立

作者:王海波; 王多春; 毕振强; 阚飙气单胞菌嗜水聚合酶链反应评价研究

摘要:目的建立嗜水气单胞菌TaqMan实时PCR实验室检测方法。方法根据嗜水气单胞菌主要黏附素基因(aeromonas hydrophila major adhesion gene,aha)的保守序列设计引物和TaqMan探针。引物选取200~700nmol/L6个浓度梯度,探针选取100~400nmol/L4个浓度梯度,以完全随机设计资料的方差分析分别优化引物和探针的浓度。以45株霍乱弧菌、20株副溶血弧菌、10株河流弧菌、4株拟态弧菌、5株创伤弧菌、1株溶藻弧菌、1株弗尼斯弧菌、5株沙门菌属细菌、10株志贺菌属细菌和2株类志贸邻单胞菌为对照,评价该方法的特异性。对所建立的方法进行菌液灵敏度检测和DNA灵敏度检测,并将嗜水气单胞菌人工污染健康人的粪便,实验室内评价该方法从粪便中检测嗜水气单胞菌的能力。结果6组引物浓度所得的循环阈值(cycle threshold,Ct)分别为(x^- ±s):20.69±0.33、20.72±0.21、20.81±0.12、20.74±0.12、20.51±0.16和20.69±0.11,选择上下游引物的浓度为200nmol/L(F=1.33,P=0.28),4组探针浓度所得的Ct值分别为(x^- ±s):20.56±0.08、20.82±0.05、20.82±0.11和20.93±0.09,选择探针的浓度为100nmol/L(F=5.26,P=0.01)。该方法DNA的检测下限为100fg/μl,纯菌液的检测下限为80CFU/ml,粪便中嗜水气单胞菌的检测下限为8×10^3CFU/ml,人工粪便标本增菌8h后的检测下限为8CFU/ml。该方法对其他细菌的染色体无扩增。结论以aha基因为目标检测片段建立的嗜水气单胞菌实时PCR方法灵敏度高、特异度强,可用于纯菌和粪便标本中嗜水气单胞菌的快速检测。

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