作者：王少珍; 廖联明药物性肝损伤黄药子数字基因表达文库药理作用分子作用机制
摘要：目的分析中药黄药子水提取物诱导小鼠肝损伤后的基因表达谱,探讨黄药子中毒导致肝损伤的分子作用机制。方法 SPF级雌性昆明小鼠40只,按随机数字表法分为4组,每组10只。黄药子干预组小鼠分别以低（6 g/kg/d）、中（12 g/kg/d）、高（24 g/kg/d）剂量的黄药子水提取物连续灌胃21 d,正常对照组以同体积纯水灌胃。对比观察4组小鼠的体重增长值、肝脏指数、血清丙氨酸氨基转移酶（ALT）和天冬氨酸转移酶（AST）活性以及肝组织经苏木精-伊红（HE）染色后的病理变化,确定可引起小鼠明显肝损伤的给药剂量。利用RNA-Seq技术分别构建黄药子诱导组（DB组）和对照组（Normal组）小鼠肝脏的数字化基因表达谱（DGE）文库,对比两个DGE文库的差异表达基因,并进行基因本体论（GO）功能注释和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析。结果与对照组相比,仅高剂量组小鼠出现明显的肝损伤,表现为同时存在体重增长值降低、肝脏指数增高、ALT及AST活性增高（P均〈0.05）以及肝组织病理学变化（结构明显破坏、肝索受压紊乱、肝细胞明显肿胀且呈气球样变性、肝小叶内中性粒细胞浸润）。以高剂量组小鼠为DB诱导组,对照组为Normal组,分别测序并构建肝组织的DGE文库：两组分别检测出13 214 893和11 124 617条碱基序列,过滤并剔除带有接头、带有N碱基和测序质量低的reads后分别得到12 819 933和10 786 300条序列。根据所得的两组DEG文库,对比筛选出了312个显著差异表达的基因,其中上调基因148个,下调基因164个。对两组差异表达基因进行聚类分析：两组均表达的高质量序列有9537个,仅在DB组表达的有702个,仅在Nomal组表达的有539个。GO功能注释主要归类为生物学过程和分子功能两个条目。根据KEGG通路分析结果,差异表达的基因主要涉及8条通路：视黄醇代谢通路、花生四烯酸�
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