天津地区汉坦病毒分离株TJJ16S基因片段克隆和序列分析

作者：李力; 杨东靖; 陈锦英; 丁建清; 苏旭; 田...汉坦病毒s基因片段序列分析病毒分离株天津地区汉坦病毒感染核苷酸序列克隆开放读码框架

摘要：目的了解天津地区汉坦病毒分离株TJJ16 S基因的分子特征. 方法采用细胞培养法从鼠肺标本中分离汉坦病毒,命名为TJJ16,提取TJJ16感染Vero-E6细胞的总RNA,经逆转录扩增病毒cDNA,继而进行PCR扩增S基因片段,纯化后克隆于pMD-18T载体,测定核苷酸序列并进行分析. 结果天津地区首次从社鼠中分离出汉坦病毒TJJ16,其S基因片段全序列长为1701 nt.只有1个编码N蛋白的开放读码框架(ORF),起始密码子为第37 nt,终止于1326 nt,推导其编码的蛋白长为429个氨基酸.经核苷酸系统发生树分析,TJJ16株应归属为汉坦病毒的汉滩型(HTN型)毒株,与HTN型新亚型A16株同属一个亚型. 结论 TJJ16病毒株的分离与S基因片段序列分析,证实在天津市鼠间存在HTN型汉坦病毒感染,对临床和流行病学的研究具有重要意义.

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