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HCV Core蛋白与IFN敏感性相关结构及功能的生物信息学分析

作者:程玲; 郭艳; 洪国祜; 毛青肝炎丙型病毒核心蛋白质类生物信息学分析基因结构干扰素类

摘要:目的生物信息学工具分析不同基因型HCVCore蛋白与IFN敏感性相关的结构功能及差异。方法应用生物信息学工具对不同基因型HCVCore蛋白二级结构、三级结构、修饰位点及主要功能结构域预测分析。结果HCVCore蛋白氨基酸序列、二级结构、三级结构各型间存在差异,可能存在酰胺化、cAMP依赖的激酶、PKC、TYR磷酸化等修饰位点及与两性蛋白SH3结构域、ERK、PKC相互作用的区域。结论不同基因型HCVCore蛋白结构功能不同影响IFN治疗敏感性。

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中华实验和临床病毒学

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