青岛地区2000-2003年HFRS患者汉坦病毒部分M基因的检测及其分型研究

作者：乔刚; 逄淑申; 张洪乐; 龚艳; 程茂玲; 李...seo型汉坦病毒hfrs患者青岛地区分型m基因扩增特异性引物毒株疫区

摘要：目的调查山东省青岛地区2000-2003年汉坦病毒的流行情况,研究病毒在该地区的分子流行病学特征.方法采集肾综合征出血热(HFRS)急性期患者血清标本64份,提取血清中病毒RNA作为模板,根据GenBank中汉坦病毒基因序列,设计HTN型和SEO型的通用外套引物,同时分别设计HTN和SEO型的特异性引物作为内套引物,RT-nest-PCR扩增汉坦病毒基因组M片段G1区基因并测序.利用DNA Star软件进行核苷酸序列分析.结果在64份标本中,用HTN型特异性引物扩增出6份,占9%;用SEO型特异性引物扩增出25份,占39%;总阳性率为48%.总体看来青岛地区流行的毒株以SEO为主.SEO型汉坦病毒间核苷酸序列的差异相对较小,其基因的离散率为0.3%～8.9%.HTN型汉坦病毒的变异率较高,其基因的离散率为2.6%～11.2%.结论青岛地区是以SEO型汉坦病毒的流行为主,HTN型并存的混合疫区;其中HTN型主要发现在胶南市.

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