福建省新分离3株乙型脑炎病毒的分子特征鉴定

作者：陈端; 王环宇; 付士红; 宋宏; 邓娟; 杨益...乙型脑炎病毒jev分离基因e蛋白分子特征减毒活疫苗区段氨基酸同源性

摘要：目的确定福建省新分离乙型脑炎病毒(JEV)的基因分型及其E区段氨基酸序列特征.方法用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增并克隆新分离JEV(02-41、02-43、02-102)的PrM、E区段核苷酸序列,测序后应用Clustal X软件做碱基配对和比较分析,种系发生采用PHYLIP软件包分析.结果新分离的3株JEV属于基因Ⅲ型,E区段核苷酸和氨基酸与减毒活疫苗株SA 14-14-2株的同源性均在96%以上,在关键结构域有部分氨基酸差异.结论福建省新分离的3株病毒属于基因Ⅲ型JEV,E蛋白与疫苗株相比有部分氨基酸差异.

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