作者:何小莉; 梁海英; 曾智勇; 汤德元; 王彬; ...贵州伪狂犬病病毒ge基因tk基因生物信息学分析
摘要:本试验通过对贵州省某规模化猪场疑似猪伪狂犬病发病猪进行病理剖检病变观察及PCR检测,并对其主要毒力基因(gE、TK基因)进行克隆测序及遗传进化分析。结果表明,该发病猪内脏组织器官多处发生病变,PCR检测为PRV野毒阳性,将其命名为PRV GZDZ2016株;序列分析结果显示该,毒株gE基因与参考毒株相比存在多个位点的插入与替换,并与近年来报道的变异毒株核苷酸及氨基酸序列相似性最高,分别为97. 7%-99. 9%和98. 8%-99. 7%; TK基因序列与标准毒株相比,存在两个位点的替换,与国内近几年分离的毒株的核苷酸同源性和氨基酸相似性最高,分别为99. 5%-99. 8%和98. 8%-99. 4%。遗传进化树显示,PRV GZDZ2016株gE基因和TK基因均与国内近几年的分离株亲缘关系较近,与国外分离株亲缘关系较远。
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