作者：吕冰; 李兆娜; 刘梅; 刘志广; 赵秀芹; 万...结核分枝杆菌可变数目串联重复序列基闪分型
摘要：目的评价结核分枝杆菌基因组中串联重复序列（VNTR）位点在中国结核分枝杆菌临床分离株的分型鉴定的分辨力。方法参考http：／／minisatellites.u-psud.fr／网站记载的位点选取其中VNTR位点，参照H37Rv结核分枝杆菌标准株全基因序列，利用DNAStar软件设计引物，采用PCR分别对中国结核分枝杆菌临床来分离株和H37Rv标准株的VNTR位点进行检测，根据PCR凝胶电泳图片中各菌株相应位点扩增产物的大小，确定重复单元的重复次数。计算Hunter-Gaston指数来分析各位点的分辨能力，及各位点合并分辨力。结果共检测135株中国结核分枝杆菌临床分离株和H37Rv标准株的45个VNTR位点。结果显示45个VNTR位点对136株菌的分辨力各不相同，Hunter-Gaston指数最大者为0.814（0.797-0.830），最小者为O.015（0.001-0.028），〉0.5的有13个位点。位点的合并分辨力分析显示，随着位点数量增加，分辨力增强，如Qubll-b和Qub18两个位点合并分析，Hunter-Gaston指数为0.936，分组数为44组；Qub11-b、Qub18、Mtub21、Rv2372、MIRU26、Qub26、Qub4156c、Qub11-a和Qub15等9个位点合并分析，Hunter-Gaston指数已经达到1，组数为136组，表示已达到最大分辨力，即株水平分型。结论不同VNTR位点具有不同的分辨力。其分型分辨力，多位点联合明显好于单位点。Qub11-b等9个位点的合并分型能力较好，这些位点有利于结核分枝杆菌的分型研究。
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