作者:李健; 丁志平; 曾婷; 文思远; 乔平; 张敏...荧光标记引物基因芯片技术扩增片段试验条多重分型优化计算机辅助设计
摘要:基因芯片技术以其平行高效多位点多态性分型的优势,在基础和临床研究中被广泛应用。然而,随着位点增多,扩增目的片段更繁琐,为了提高效率和降低成本,就需要在同一反应体系内进行多重扩增。而多重扩增的关键问题是,同一体系内引物对的最大化,并有效减少非特异扩增。目前,此环节可通过计算机辅助设计和尝试不同引物对组合解决。由于芯片分型以杂交信号强弱为检测指标,扩增片段要载有荧光剂,因此多重扩增必须考虑到荧光标记物——青色素(Cy3)的大分子位阻效应。但是,Cy3的存在不可避免地降低了PCR的效率,为此本研究对相关试验条件进行优化。
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