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cDNA基因芯片技术在血管内皮细胞基因变化研究中的质量保证过程

作者:张曼; 王京; 李莉基因芯片技术质量保证变化研究血管内皮内皮细胞基因表达cdna基因芯片冠状动脉血管排除干扰分析质量有效数据重复试验荧光强度杂交反应总rna特异错配不确定等因素重复性多因素客观性本底

摘要:目的探讨Cdna基因芯片技术在应用过程中如何排除干扰,保证分析质量,获得进一步归纳分析的有效数据.方法通过排除非特异本底、点样均一误差、非特异错配、同源组织错配等各方面因素,应用10 368个基因的Cdna基因芯片研究人冠状动脉血管内皮细胞基因表达的总体变化趋势和不同功能集团间的分析,逐步分析不同干扰因素,获得有效处理数据.结果三次重复试验中10 368个基因芯片反应数据分别排除89、132和116个低于非特异本底荧光强度的杂交点,281、368和220个少于荧光杂交面积10 %的不确定杂交反应,1 113、1 026和1 096个不同种属间非特异错配,重复性筛选等因素,获得相对有效的与参考总RNA比较表达高于1.5倍323个,低于1.5倍1 192个,高低1.5倍之间的 2 036个数据.结论基因芯片技术在应用过程中受许多因素的影响,经过切实有效的方法排除干扰因素,可获得较具有客观性的结果,是进一步分析的必要前提.

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