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基于叶绿体psbA-trnH基因间隔区序列鉴别维吾尔药刺山柑

作者:程波; 杨伟俊; 刘欢欢; 何江刺山柑叶绿体dna分子鉴定

摘要:目的通过比较分析刺山柑(Capparis spinosa L.)与山柑科或山柑属药用植物的叶绿体psbA-trnH基因间隔区序列,为刺山柑的分子生物学鉴别研究提供参考依据。方法提取植物样品基因组总DNA,扩增叶绿体psbA-trnH基因间隔区序列,运用MEGA7为工具对序列进行多重序列比对,以Kimura 2 parameter(K2P)为模型估算种内种间遗传距离,并以非加权组平均法(UPGMA)构建系统发生树。结果与刺山柑相比,其种间遗传距离在0.045~0.474,平均种间遗传距离为0.238。最小种间遗传距离大于最大种内遗传距离。UPGMA聚类结果显示,各个种内平行样本相聚,刺山柑与8种同科或同属植物被有效区分。结论叶绿体psbA-trnH基因间隔区序列对于刺山柑的鉴别研究具有应用价值。

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