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河北省甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因特征研究

作者:韩光跃 申悦霞 刘艳芳 李岩 刘兰芬 李琦 ...甲型h1n1流行性感冒血凝素基因抗原变异种系进化分析

摘要:目的掌握河北省甲型H1N1流行性感冒(甲流)病毒的流行情况;对分离到的甲流病毒株血凝素(Hemagglutinin,HA)基因序列进行测定比较,分析HA重链区(HA1)第222位氨基酸位点的突变情况。此位点编码的天冬氨酸(Aspartic Acid,N)突变为甘氨酸(Glycine,G)(D222G),可能会使病毒更容易结合下呼吸道受体,为流感大流行的预防控制提供参考。方法采集流感样病例的鼻咽拭子,用狗肾传代细胞分离流感病毒,经血凝抑制试验鉴定分型。选取不同时间、地域的10株甲流病毒进行HA基因全序列分析,167株病毒测HA区3791204片段,用DNA(脱氧核糖核酸,Deoxyribonucleic Acid)Star软件比较分析同源性、变异趋势。结果10株甲流病毒毒株HA基因与疫苗株A(甲)/California(加利福尼亚)/07/2009相比高度同源,核苷酸同源性为98.9%~99.5%,氨基酸同源性为98.4%~99.3%,有3个位点氨基酸发生同样的替换(脯氨酸,Proline)100S(丝氨酸,Sefine),$220T(苏氨酸,Threonine),E(谷氨酸,GlutamicAcid)391K(赖氨酸,Lysine)。从采集于2010年12月标本分离的2株甲流病毒A/河北桥东/SWL(Swine-like)178/2010和A/河北裕华/SWL1261/2010,在202、214、468三个氨基酸位点与其他毒株不同。所有167株甲流病毒的HA,第222位氨基酸均未发生D222G突变。结论河北省甲流病毒HA基因与疫苗株A/Califomia107/2009高度同源,与疫苗株及各毒株之间核苷酸同源性均≥98.9%,尚未发现D222G变异。

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