作者：何庆元; 向仕华; 杨华伟; 黄守程; 舒英杰...大豆川渝地区ssr标记进化地方品种育成品种
摘要：利用基本均匀分布于大豆20条染色体的135对SSR标记,对232份包括6个地方品种地域亚群和1个育成品种亚群进行全基因组扫描。结果表明：所有的标记都有多态性,所有检测到的位点都是纯合基因型,说明所选用品种高度纯合,每个标记存在2~4个等位变异,平均2.66个。亚群多态性信息含量变异范围0.275 1~0.316 5,整个群体为0.320 8;亚群内Nei遗传距离变异范围0.325 8~0.359 4,整个群体为0.371 1,说明川渝地区大豆遗传变异较小。亚群间的遗传一致度（GI≥0.886 2）较高,遗传距离（GD≤0.120 8）较小,地方品种亚群间遗传差异更小,育成品种亚群与自然地域亚群的遗传差异相对较大。亚群间基因分化系数（Fst）平均为0.072 2,基因流（Nm）平均为3.214,说明不同亚群之间存在一定的基因交流。主坐标分析表明第一、二和三主成分分别解释总变异的4.97%、3.54%和3.33%。来自同一区域的品种资源基本聚集在同一亚群,聚类分析同样表明同一自然地域亚群品种资源虽不能完全聚集到同一个遗传类群中,但具有一定的聚集效应,说明川渝大豆品种资源遗传变异与地理位置有一定的关系。分子方差分析表明亚群内变异占总变异的97%,亚群间变异仅占总变异的3%。Mantel收敛分析表明地方品种自然地域亚群的遗传距离与所处的地理位置距离（纬度和海拔）呈显著的正相关关系（R2=0.722）。川渝地区大豆种质资源群体遗传丰富度不高,当前的育成品种未蕴含本地区所有遗传变异。
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