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大豆基因组GmRAV同源基因的生物信息学分析

作者:赵琳 罗秋兰 高阳 滕卫丽 李海燕 陈李淼 ...大豆rav光周期b3结构域

摘要:利用Phytozome数据库、NCBI网站,和MEGA4.0、ClustalX软件对大豆(Glycine max)基因组中RAV同源基因进行了生物信息学分析,发现大豆RAV基因有4个拷贝,分别分布于第1、2、10和20号染色体上;RAV蛋白含有AP2/ERF(53~108)和B3(172~286)结构域。豆科植物大豆、东方山羊豆和苜蓿RAV蛋白亲缘关系较近。大豆的RAV基因4个拷贝中,Glyma01g22260与Glyma02g11060亲缘关系最近并且与苜蓿聚为一类,GmRAV和Gly-ma20g32730的亲缘关系也很近,并且与东方山羊豆聚为一类。推测大豆4个RAV拷贝在进化过程中功能上发生了较大的分化,在光周期抑制开花过程中可能发挥着重要作用。

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中国油料作物学报

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