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宠物鸟H3N8亚型流感病毒HA基因的特征性分析

作者:张云; 刘明; 倪健强; 华荣虹; 于康震; 曲...ha基因宠物鸟位点流感病毒毒株同源性基因序列测定亚型受体结合糖基化

摘要:来自香港和世界各地的10株宠物鸟H3N8流感病毒的HA基因进行了全基因序列测定,用DNASTAR和Tree-View软件进行序列编辑,序列翻译,进化树绘制和分子演化分析.结果表明来自不同国家和地区的H3N8流感病毒的HA基因都非常相似,都形成一个独立的分支,属于欧亚亚系,同源率为95.9%~100%;香港2001年宠物鸟的毒株之间的同源率最高,分别为99.2%~100%.HA基因与A/Equine/Jilin/89(H3N8)的同源性为最高,在92.9%~93.6%之间.氨基酸分析表明只有A/Parakeet/Netherland/33/01的HA基因在97~99受体结合位点处有一个额外潜在的糖基化位点NKT;因此可见宠物鸟H3N8流感病毒的HA基因高度保守,HA基因均来自共同的祖先.

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