作者：姜瀚林; 程林发; 姜鹏超; 郭兆奎; 刘永中...马铃薯y病毒基因组全序列系统发育分析重组分析
摘要：为明确黑龙江烟区马铃薯 Y 病毒(Potato virus Y,PVY)分子株系和进化特征,从哈尔滨和牡丹江感病烟草采集到Harbin 和 MDJ 两个样品,通过 RT-PCR 扩增了其全基因组序列,并进行了一致率、重组、系统发育和选择压力等分析。结果表明,2 个分离物(GenBank 登录号分别为 MH933741 和 MH933742)基因组全长均为 9699 核苷酸。Harbin 与 MDJ 和比利时分离物 GBVC 26(JQ969039)一致率最高,为 98.5%;MDJ 与 Harbin 和 GBVC 26 一致率最高,为 98.5%。Harbin 是美国分离物 Oz和瑞士分离物 N-605 的重组体,MDJ 是美国分离物 CW 和 N-605 的重组体。利用全基因组序列构建的系统进化树显示,PVY 分离物分为 9 个组,Harbin 和 MDJ 均属 PVYN-Wi 组。PVY 的 11 个基因均处于负选择,其中 NIa 蛋白基因的选择压力最大。
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