作者:杨永霞 牛志强 张松涛 崔红 刘国顺烟草克隆类胡萝卜素裂解双氧合酶序列分析
摘要:为深入探索CCD1的功能,利用RACE方法获得了烟草品种K326类胡萝卜素降解关键基因CCD1的2个cDNA全长序列。序列分析表明,CCD1-1与CCD1-2各包含一个1635和1647bp的开放读码框(ORF),编码544和548个氨基酸。分别与林烟草和绒毛状烟草CCD1存在一个碱基的差异。CCD1-1与CCD1-2基因序列GC含量为43.24%和42.87%。预测的蛋白质分子量均为61 kDa,理论等电点(pI)6.51和6.55。与番茄和辣椒等植物的类胡萝卜素CCD1的同源性达到80%以上。跨膜区预测表明分别在138~158和142~162位氨基酸间有1个跨膜螺旋区。蛋白质二级结构分析表明,均以β折叠和无规则卷曲为主。蛋白三维结构预测分析表明CCD1-1与CCD1-2空间结构极为相似。组织表达分析表明,CCD1-1与CCD1-2在花中的表达最强,根中的表达最弱,茎和叶次之。这些结果为进一步研究类胡萝卜素降解基因的功能提供了依据。
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