作者：王芳 高正良 周本国 许大凤 安梦楠 吴元...烟草pvyn基因组全序列重组分析
摘要：利用引起烟草脉坏死病的马铃薯Y病毒脉坏死株系辽宁分离物（PotatovirusY—veinnecrosisstrainLiaoningisolate，PvY”LN），以GenBank中已有的PvY全序列为基础，设计特异引物。通过总RNA提取、RT-PCR、3’RACE和5’RACE扩增及序列测定，测得PvY”“全长基因组序列（NCBI登录号为JQ971975）包括9714个碱基（含PolyA尾），整条序列仅包含一个由9186个碱基组成的开放读码框（ORF），编码一条包含3061个氨基酸的多聚蛋白。对所得序列进行BLAST，利用MEGA软件对所测得的PvY”“全序列与GenBank中已有的PVY全序列及氨基酸进行系统进化分析，发现PVYN。LN分离物与己报道的PVY”株系具有较高的进化亲缘关系，该分离物属于pvyN株系。序列重组分析软件RDP4分析，该序列无重组。
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