作者：王飞; 宗秋芳; 慕京生; 吴圣龙; 包文斌猪myod1基因akt3基因启动子多态性生物信息学
摘要：为探究MYOD 1和AKT 3基因启动子区的多态性及其可能存在的影响基因表达的分子调控机制,试验采用PCR直接测序的方法对大白猪MYOD 1和AKT 3基因启动子区的多态性进行检测,同时利用生物信息学分析方法预测了大白猪MYOD 1和AKT 3基因的核心启动子区、CpG岛和转录因子结合域。结果显示,MYOD 1基因共预测到5个核心启动子区、1个CpG岛区域和10个转录因子结合域,且第5个核心启动子区位于CpG岛区域内;AKT 3基因共预测到6个核心启动子区,未发现CpG岛的存在。通过直接测序的方法检测到MYOD 1基因在G-361T处存在1个SNP突变,但在本试验群体中只发现1种基因型,同时该突变位点位于第1个核心启动子区内;AKT 3基因在启动子区T-1709C处存在1个SNP突变,包括TT、TC和CC 3种基因型,其中TT基因型为优势基因型,T为优势等位基因。遗传多态性分析提示,该突变位点多态信息含量(PIC)介于0.25~0.5之间,表现为中度多态。本研究初步探究了大白猪MYOD 1和AKT 3基因启动子区的多态性并预测了启动子区可能的调控因子和调控元件,为进一步研究MYOD 1、AKT 3基因对肌肉生长发育的调控机制及将突变位点作为遗传标记用于分子选育提供指导和依据。
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