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关岭牛解偶联蛋白3基因5′侧翼区克隆和生物信息学分析

作者:陈伟 许厚强 刘忠伟 陈祥 张雯 桓聪聪关岭牛解偶联蛋白3基因启动子转录因子

摘要:本试验对贵州关岭牛解偶联蛋白3(uncoupling protein,UCP3)基因5′侧翼区进行克隆,并利用生物信息学软件对其1080bp的克隆序列进行分析,以研究UCP3基因5′侧翼区特异性转录调控元件的调控机制。软件分析发现关岭牛UCP3基因5′侧翼区含有6个可能的转录起始点和33个潜在转录因子结合位点,与东北虎、家猫、印度水牛、藏羚羊、山羊、绵羊UCP3基因5′侧翼区(-196~+100bp)序列相似性分别为82%、82%、98%、95%、96%和98%;该区域保守性较强,推测转录起始点上游-200~+1bp可能是其核心启动子区域,该区域在调控基因转录和翻译方面具有共同的作用。试验成功克隆了UCP3基因5′侧翼区序列1080bp,初步预测了该基因的核心启动子区。

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中国畜牧兽医

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