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普通冠状病毒229E株的分子流行病学分析

作者:马淑霞; 李金梁; 谷鸿喜; 杨景云犬冠状病毒发热病人腹膜炎分子流行病学哈尔滨地区n基因tgev猪流行性腹泻病毒同源性

摘要:目的明确哈尔滨地区普通冠状病毒229E(Human Coronavirus-229EHcoV-229E)株的流行和变异情况及其与SARS-CoV的异同,为进一步掌握该地区常见上呼吸道病毒的流行规律及预防,乃至疫苗的制备打下基础.方法利用RT-PCR法对2003年上半年采集的部分发热病人血清及血细胞进行筛选,同时采用基因测序、序列分析等手段对扩增的HcoV-229E N gene片断进行蛋白和基因分析.结果55例标本中HcoV-229E RNA阳性病例5例,占9.09%;测序结果看出哈尔滨地区检出229E株N基因的序列与已公布的HcoV-229E N gene(295-802)序列完全相同,所测片断为HcoV-229E N gene的部分序列.该基因与猪流行性腹泻病毒、犬冠状病毒、TGEV及猫感染性腹膜炎病毒有一定同源性;但与已公布的SARS-CoVN gene序列比较,相似性小于1%.结论(1)该地区发热病人普通冠状病毒229E株阳性率为9.09%;(2)哈尔滨地区流行的HcoV N基因无变异发生;(3)HcoV-229E与猪流行性腹泻病毒、犬冠状病毒、TGEV和猫感染性腹膜炎病毒有一定的同源性;(4)哈尔滨地区HcoV-229E N gene与SARSCoV N gene相似性小于1%.

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