作者：顾玲 丁震 汪华 陈晓东 李伟伟 叶殉 刘晓...微生物源追踪大肠埃希菌细菌基因组重复序列pcr抗生素敏感性试验平均正确归类率粪便污染
摘要：目的：用两种不同的微生物源追踪（Microbial source tracking,MST）方法对江苏省盱眙县桂五水库粪便污染来源进行追踪。方法：于春、夏、秋、冬4季分别采集水库周边已知来源粪便标本,分离大肠埃希菌并作为指示菌,分别建立已知源指示菌细菌基因组重复序列PCR（repetitive Extragenic Palindromic-Polymerase chain reaction,rep-PCR）特征指纹库和已知源指示菌抗生素敏感性（Antibiotic Resistance Analysis,ARA）数据库,并分别用统计分析及试验设计软件（JMP7.0软件）和基因聚类分析软件（Bionumerics 4.0软件）计算平均正确归类率（Average Rate of Correct Classification,ARCC）,以检验各自的宿主来源区分效果。同期采集水样,膜过滤法分离并确认指示菌,分别进行rep-PCR扩增和ARA试验,并分别与已知源指示菌rep-PCR特征指纹库和ARA数据库进行统计学比对,判断桂五水库中粪便污染来源。结果：将已知源指示菌rep-PCR特征指纹库和ARA数据库分别分为2、3、4、5和9类时,平均正确归类率分别为：89.19%、77.58%、76.69%、75.25%、70.92%和88.59%、84.98%、80.81%、79.58%、76.71%。两个已知源指示菌数据库均可较好地区分指示菌的不同来源。rep-PCR微生物源追踪和ARA微生物源追踪分别对534和547株水样指示菌进行了分析,判别分析结果分别显示人、鸡、鸭、鹅、狗、猪、牛、羊和野生动物各占26.49%、14.74%、7.77%、5.78%、3.98%、7.97%、10.96%、8.76%、8.57%和32.72%、8.78%、1.28%、2.01%、9.51%、12.98%、1.83%、28.34%、1.83%。结论：水体标本监测结果显示桂五水库粪便污染来源种类繁多,两种方法追踪结果不尽相同,rep-PCR法提示人、鸡和牛为主要污染源,ARA法结果显示人、羊和猪是最主要的污染贡献者,这可能与两法所选指示菌不完全相同有关,也可能是方法本身的差异导致源追踪结果有差异。
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