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小反刍兽疫病毒N基因部分序列分子演化规律

作者:王净; 王鹏; 王长顺pprvn基因分子进化树最大似然法遗传距离

摘要:为分析中国小反刍兽疫的流行特点,本研究采用生物信息学方法,从NCBI下载小反刍兽疫病毒(PPRV)N基因,以最大似然法建立分子进化树。结果显示,中国PPRV流行株分布于Ⅳ系,有2个分支,2007—2008年中国西藏流行株与2003年印度毒株遗传关系最近,2013—2015年中国西藏流行株与2012年巴基斯坦毒株遗传关系最近。中国小反刍兽疫主要发生于山羊,2015年新疆巴州毒株来自阿尔卑斯野山羊,与2013年以来的毒株在同一分支。China—BJ_2014与China—XJBZ_2015的遗传距离为0.0117。中国两簇PPRV分支均与西部邻国毒株遗传关系最近,目前出现多宿主和变异性的流行特点,本研究为有效防控PPRV疫情提供基本的科学依据。

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