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捕食性真菌Duddingtonia flagrans基因组DNA的提取及基因组survey分析

作者:张伟; 王瑞; 杨晓野; 祝晓蕊; 王新芳; 梁...捕食性真菌duddingtoniaflagrans13na提取基因组测序gc含量杂合度

摘要:采用透析膜培养法结合DNA柱式提取法进行基因组DNA提取,同时利用第2代高通量测序技术,分析了捕食性真菌Duddingtonia flagrans基因组概况。结果显示:透析膜培养结合DNA柱式提取法所提取的基因组DNA质量及浓度均能达到测序标准;捕食性真菌Duddingtonia尼agrans基因组约为37.6Mb,GC含量为44.95%,基因组杂合度较低。结果表明:透析膜培养法结合柱式法提取其基因组DNA的方法简便可行,为丝状真菌DNA提取,提供了新的思路;基因组survey分析为捕食性真菌Duddingtonia理agrans全基因组精细图谱的绘制奠定了基础。

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