作者：孟庆玲; 乔军; 陈创夫犬瘟热病毒tn野毒株核蛋白基因克隆序列分析分子结构氨基酸cdv
摘要：根据GenBank中收录的犬瘟热病毒(CDV)Onderstepoort株核蛋白基因(N)序列,设计了1对特异性引物,用该引物对分离的TN野毒株进行了RT-PCR扩增;将扩增得到的PCR片段纯化后与pGEM-T质粒连接,得到重组质粒pTN.经核苷酸序列测定,CDV TN株N基因的ORF全长1 569 bp,编码523个氨基酸;将TN野毒株与GenBank中收录的其他CDV毒株进行比较,N基因核苷酸序列的同源性为94%～99%,推导的N蛋白氨基酸序列的同源性为97%～99%.TN株与Onderstepoort疫苗株氨基酸序列的差异主要集中在N端(17～159位)和C端(408～519位),中间的区域则高度保守.此外,在CDV N蛋白N端281～289位上也发现存在与麻疹病毒(MV)N蛋白完全相同的Y-P-A-L-G-L-H-E-F 9肽序列,推测可能是诱导CTL活性的靶蛋白的抗原表位之一.氨基酸组成分析发现,推导的N蛋白氨基酸序列中亮氨酸、丝氨酸和异亮氨酸所占比例很高,提示该蛋白具有高度螺旋和缠绕的分子结构.
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