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一个基于知识的蛋白质结构预测评分函数

作者:张毓敏; 章鲁评分函数蛋白质结构预测蛋白质诱饵

摘要:评分函数设计是预测蛋白质结构的关键之一。本研究采用pab_select 25列表中的蛋白质结构作为学习样本,并按照结构测定方法的不同将其分成X-Team和NMR—Team两组。根据学习样本中两两氨基酸残基的距离分布,分别求出两组评分函数。然后使用公认的测试样本数据评估上述评分函数的性能。结果表明:两组评分函数在识别结果上存在一致性,且总体性能较高,但X-Team评分函数的识别质量高于NMR—Team评分函数。

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中国生物医学工程学报

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