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猪轮状病毒JL94中国分离株衣壳蛋白基因的分析

作者:宋岩; 李丹丹; 师东方; 魏华; 陈淑红; 李...jl94株猪轮状病毒中国分离株vp7基因氨基酸同源性vp6基因vp4基因衣壳蛋白抗病毒疫苗亚群

摘要:根据GenBank发表的猪轮状病毒衣壳蛋白vp4基因、vp6基因和vp7基因保守序列,设计合成3对引物,分别扩增猪轮状病毒中国分离株JL94株的此3段基因并进行序列分析.结果表明,JL94株vp4基因与国外分离株CRW-8株、OSU株、Gottfried株、4F株和4S株的VP4氨基酸同源性分别为97.16%、95%、71.88%、73.45%和70.88%;JL94株vp6与CRW-8株、OSU株、Gotffried株、4F株和4S株的VP6氨基酸同源性分别为96.98%、97.48%、93.20%、97.48%和93%;JL94株vp7基因与CRW-8株、OSU株、Gottfried株、4F株和4S株的VP7氨基酸同源性分别为98%、99.90%、75.40%、84.66%和80%.可见JL94株同CRW-8株、OSU株同源性更高些;vp4和vp7基因在同型间高度保守而不同型间差距较大,vp6基因在同群和非同群间差别不是很明显.同时可以判定JL94属于A群I亚群G5P7血清型PRV.研究猪轮状病毒中国分离株JL94株衣壳蛋白基因的特征,为研制高效抗病毒疫苗奠定基础.

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