作者：黄丽丽; 孙海龙; 倪永清; 周红鲤鱼肠道微生物高通量测序技术
摘要：为了解新疆额尔齐斯河流域野生鲤鱼肠道细菌的多样性及其群落结构组成,采用高通量测序技术对鲤鱼肠道中细菌16S rRNA V4区基因进行检测,并比较鲤鱼肠道不同区段中细菌群落结构组成及多样性,结果共获得35 289条有效序列,158个OTUs。多样性分析表明,鲤鱼后肠的Shannon指数最低,细菌群落结构最为复杂;而前肠和中肠的Shannon和Simpson指数接近一致。在门水平上,鲤鱼肠道样品中主要以厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门和放线菌门为主,前肠和中肠中变形菌门是最占优势的菌群门,而后肠中变形菌门比例减少,厚壁菌门显著增加。属水平后肠主要以肉食杆菌为主,所占比例达30.52%,而前肠和中肠硫杆菌占主导地位。额尔齐斯河冷水性鲤鱼肠道细菌群落组成多样,前肠和中肠的细菌群落结构组成较为相似,与后肠细菌群落结构及多样性差异显著。
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