作者:唐爽捷; 饶丽; 陈珺; 卢丽swissdock黄芩素bmpii型受体
摘要:目的 以实例详述Swiss Dock系统在蛋白质-小分子对接预测中的应用,为科研工作者运用此系统提供参考。方法以黄芩素(小分子)与BMPII型受体(靶蛋白)为研究对象,详细介绍Swiss Dock系统的相关操作,并进行结果分析。结果 Swiss Dock系统预测结果显示黄芩素与BMPII型受体相对接的氨基酸残基是第338位天冬酰胺(ASN338),而黄芩素与ASN338之间的距离为3.5?,对接模型G=-13.17 kcal/mol。结论 Swiss Dock系统能帮助使用者提交对接物及检索小分子与靶蛋白预测复合物的三维构象,其操作界面简单、人机交互性强,是对原子尺度的分子识别过程开展研究的有力工具。
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