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首页 期刊 中国水产科学 哲罗鱼基因组微卫星富集文库的构建与分析【正文】

哲罗鱼基因组微卫星富集文库的构建与分析

作者:佟广香; 鲁翠云; 匡友谊; 梁利群; 尹家胜...哲罗鱼微卫星磁珠富集

摘要:采用磁珠富集法构建哲罗鱼(Hucho taimen Pallas)荩因组微卫星文库。哲罗鱼基因组DNA经MboⅠ限制性内切酶消化后,选取400-900bp的片段,用生物素标记的简单重复序列(ACA)15作探针与其杂交,杂交复合物结合到包被有链霉亲和素的磁珠上,获得目的片段,连接T载体克隆,构建基因组微卫旱富集文库。再用同位素标记的(ACA)15探针进行二次筛选,筛选出686个阳性克隆,阳性克隆率为35.94%。对其中140个阳性克隆进行测序,共获得149个微卫星序列,4个小卫星序列,其GenBank Accession Number为DQ110955~DQ121108。其中perfect(完美型)62个,占41.61%;imperfect(非完美型)92个,占61.74%;compound(混合型)5个,占3.36%,重复次数主要分布于6~45(81.21%),平均重复次数为32.5,这表明(ACA/TGT)。在哲罗鱼基因组DNA中含最非常丰富。本研究旨为从DNA水平上研究哲岁鱼种群结构、遗传多样性及目前群体现状等方面提供有效工具。

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中国水产科学

《中国水产科学》(月刊)创刊于1994年,由中华人民共和国农业农村部主管,中国水产科学研究院;中国水产学会;中国科技出版传媒股份有限公司主办,CN刊号为:11-3446/S,自创刊以来,颇受业界和广大读者的关注和好评。

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