作者：申萍香 黄艳 黄江 胡旭初 余新炳 徐劲 廖...亚洲牛带绦虫乳酸脱氢酶结构与功能生物信息学
摘要：目的分析和预测亚洲牛带绦虫（Taeniasaginata asiatica,Ta）乳酸脱氢酶（lactate dehydrogenase,LDH）基因及其编码蛋白的结构和特性，以指导其生物学功能的实验研究。方法利用生物信息网站如美国国家生物技术信息中心（NC—BI,http：／／www．ncbi．nlm．nih．gov／）和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统（ExPASY，http：／／ca．expasy．org／）中有关基因和蛋白序列、结构信息分析的各种工具，结合其它生物信息学分析软件包，如DNAman和Vector NTI suite。从亚洲牛带绦虫全长cDNA质粒文库中识别乳酸脱氢酶（Tα LDH）基因及其编码区，分析、预测该基因编码的蛋白质的理化特性、抗原表位、翻译后的修饰位点、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构、三维空间构象，酶的活性中心在拓扑结构和空间构象中的位置分布等。结果该基因全长1285bp，编码区为92bp—1084bp，编码331个氨基酸，其推导氨基酸序列与其它物种乳酸脱氢酶氨基酸序列一致性达50％左右，具有乳酸脱氢酶保守结构域。其编码的蛋白相对分子量理论预测值和等电点分别是35268．9Da和8．03。其编码的蛋白有3个跨膜区、没有其它亚细胞定位序列。α螺旋（H）、β折叠（E）和无规卷曲（L）的比例分别是36．56：22．96：40，48，L-乳酸脱氢酶活化位点，位于189—195aa，Tα LDH氨基酸序列中有16个潜在抗原表位，酶催化位点的关键氨基酸在不同物种中保守，在空间结构中3个关键氨基酸相互靠近。结论应用生物信息方法从亚洲牛带绦虫成虫cDNA文库中筛选出了TaLDH的cDNA全长序列并预测得到其结构与功能方面的信息。
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