作者：独军政 候顺利 易华山 付生芳 常惠芸 才...禽流感病毒h9n2亚型序列分析
摘要：目的测定H9N2亚型禽流感病毒A／Chicken／Gansu／2／99（CK／GS／2／99）分离株的基因组序列并与参考毒株进行同源性分析，阐明该毒株的遗传变异及分子特征。方法采集发病鸡泄殖腔样品，经鸡胚尿囊腔接种分离病毒，采用RT．PCR方法对CK／GS／2／99株的8个分节段基因进行扩增，分别将其克隆到pGEM—Teasy载体后进行序列测定与同源性分析。结果CK／GS／2／99株PB2、PB1、PA、HA、NP、NA、M、NS基因的开放阅读框分别由2280、2274、2151、1683、1497、1401、759、864个碱基组成，分别编码759、757、716、560、498、466、252／97、231／122个氨基酸残基。该毒株HA上HA1和HA2裂解位点序列为PARSSR＋GLF，具有典型的低致病性禽流感病毒的特征。同源性分析显示，CK／GS／2／99株与1998—2002年间大部分中国大陆分离株遗传关系较近，尤其与CK／NX／4／99和CK／HB／3I／00株遗传关系密切。结论CK／GS／2／99·与大部分流行于中国内陆的H9N2亚型毒株均来源于共同的祖先毒株CK／BJ／1／94，这为了解中国H9N2亚型禽流感病毒的分子流行病学提供了资料。
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