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葡萄霜霉病菌实时荧光定量PCR检测体系的建立和应用

作者:李文学; 肖瑞刚; 吕苗苗; 丁宁; 石华荣; ...葡萄霜霉病菌cox2实时荧光定量pcr潜伏侵染定量检测

摘要:【目的】葡萄霜霉病是葡萄生产上重要的单年流行病害,研究旨在构建葡萄霜霉病菌(Plasmoparaviticola)的实时荧光定量PCR(real-time PCR)检测体系,为葡萄霜霉病的早期诊断和预测预报提供依据。【方法】依据GenBank 中葡萄霜霉病菌cox2 基因序列设计1 对特异性引物(F-cox-Pv/R-Pv),建立并优化常规PCR 和real-time PCR 反应体系,利用葡萄霜霉病菌、葡萄炭疽病菌(Colletotrichum gloeosporioides)、葡萄白粉病菌(Uncinula necator)、葡萄灰霉病菌(Botrytis cinerea)、葡萄白腐病菌(Coniella diplodiella)、葡萄溃疡病菌(Botryosphaeria dothidea)、白菜黑斑病菌(Alternaria br3assicae)、辣椒炭疽病菌(C. capsica)、甘草根腐病菌(Fusarium solani)、西葫芦白粉病菌(Sphaerotheca fuliginea)、番茄菌核病菌(Sclerotiniasclerotiorum)、马铃薯干腐病菌(F. equiseti)、西瓜枯萎病菌(F. oxysporum)、哈茨木霉(Trichodermaharzianum)等14 种葡萄及其他作物病原菌和拮抗菌的菌丝DNA 进行常规PCR 和real-time PCR 特异性检测,并对灵敏度和可重复性进行评价。运用已构建的real-time PCR 体系对人工接种葡萄霜霉病菌的潜育期叶片内病原菌DNA 进行定量检测,利用SPSS 19.0 软件分析接种时间与叶片内葡萄霜霉病菌潜伏侵染量的关系。【结果】研究设计的引物特异性高,常规PCR 仅对葡萄霜霉病菌DNA 有扩增条带,为139 bp;real-time PCR 检测结果表明该对引物对葡萄霜霉病菌有唯一的产物吸收峰,对其他供试菌株均未检测到产物吸收峰。常规PCR 检测的灵敏度为10 pg·μL^-1,real-time PCR 的灵敏度可达到0.1 pg·μL^-1,是常规PCR 检测灵敏度的100 倍。以携带目的基因片段的重组质粒为标准品,构建real-time PCR 循环阈值(Ct)与模板浓度的线性关系,标准曲线y=42.27-3.36x,相关系数R^2=0.997,扩增效率为98.50%,线性范围达7个数量级,在2.4×10^3—2.4×10^9 copies/μL 呈现良好的线性关系。对人工接种葡萄�

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中国农业科学

《中国农业科学》(半月刊)创刊于1960年,由中华人民共和国农业农村部主管,中国农业科学院;中国农学会主办,CN刊号为:11-1328/S,自创刊以来,颇受业界和广大读者的关注和好评。 《中国农业科学》为综合性农牧业科学学术刊物。主要发表我国农牧业科学在基础理论和应用技术方面的学术论文、重要科研成果和专题报告及各学科研究进展综述等读者对象为农牧业科技工作者、农业院校师生和农业管理干部。

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